自分が忘れてたので、使い方と感動を忘れないために。たまたまggplot2 のバージョンが更新されたのを見て、何が変わったのか見てみたら、すごく感動する仕様になっていた。その一つが、軸ラベルの重なりを防ぐ方法である。www.tidyverse.orgTest data を作成…

微生物分野ではよく使われるようになってきた、ASVによるクラスタリングをしてくれるDADA2。一般的に、いわゆる次世代シーケンサーを用いた Amplicon sequencing によって得られたデータは、得られた塩基配列情報を 95 ~ 98 % 類似していたら、同じ種であろ…

最近までRprofileの使い方がわかりませんでした。 しかし、研究室の後輩がさらっと、Rprofileを使って警告を出ないように設定していると聞いて、なんやてとなったので、調べてみました。めちゃくちゃ簡単だし、下記のサイトたちにまとめてありますね。 OSに…

Q : = の両隣にスペースが入っていないのに command not found とエラーが出る時 A : 改行コードがおかしい可能性が... for 関数を使って、スパコンに投げるための job スクリプトを作っている時 to="${input}" dir="`echo $input | cut -b 1-7 | uniq`"この…

某大学で生態学を研究している博士後期課程のものです。 修士で研究室を移ってから、まじめに研究を始めて、いろいろな人に教わったり、逆に教える機会も増えてきました。その過程で、科学において知識の共有はやっぱり大事だなと感じてきたので、ブログでは…