微生物屋のノート

プログラミング・解析関連についてのノートです。

DADA2

DADA2解説1:Install、Quality check、Filter and Trim

微生物分野ではよく使われるようになってきた、ASVによるクラスタリングをしてくれるDADA2。一般的に、いわゆる次世代シーケンサーを用いた Amplicon sequencing によって得られたデータは、得られた塩基配列情報を 95 ~ 98 % 類似していたら、同じ種であろ…